一個名叫琉克的死神把一本“死亡筆記本”遺落在了人間，被就讀于名牌大學東應大學的尖子生夜神月（藤原龍也飾）拾到了。這位被寄予厚望、將來能成為警視總監的天才，卻暗暗感到所謂法律的正義是有界限的。就在這時，這本黑色封面的筆記本出現在了月面前，本上有這樣一句話：名字被寫在筆記本上的人都會死。月雖然不相信但還是隨手寫上了從電視上看到的誘拐殺人犯的名字，第二天就得知被自己寫上的男人突然在獄中身亡。月相信了死亡筆記的能力，決定利用自己的雙手制裁犯罪者，構筑理想中的世界。逃亡中的惡性事件罪犯、借權力得以逃脫罪名的當權者，一切應該受罰卻逃脫了的人相繼神秘地死去，國際刑警組織為了調查這一連串的事件，將一個天才派往日本警察廳，他就是擁有超群情報收集能力以及神秘的推理能力、解開了許多世界上各種難以破解的案件的L（松山健一飾）。受到L的指示，日本警察、甚至連FBI也開始一起通緝基拉。L和月，兩個天才展開了對決。